Salut @Benoit_De_Haas,
Comme on n’a pas de document spécifique aux dons et que tu ne peux pas faire une facture, je pense que le plus simple est de faire:
- Une écriture de journal permettant d’enregistrer le produit associé au don:
Exemple
Dans la ligne correspondant au produit (compte 754…) tu pourras définir le centre de coût associé:
Pour info tu peux créer des modèles d’écritures de journal pour pré-remplir les bons comptes à chaque fois 
Ce serait d’ailleurs top qu’on ait un plan comptable associatif et un document pour les dons un jour dans Dokos… En attendant tu peux renommer les comptes du PCG standard pour avoir les libellés des comptes pour les associations.
- Tu crées une écriture de paiement, tu choisis le tiers payeur et tu cliques sur “Obtenir les factures en attente” pour récupérer ton écriture de journal à solder:
Et tu valides !
Pour le reçu, tu peux créer un format d’impression sur mesure basé sur les écritures de paiement.
Exemple:
Tu peux également lier le paiement avec un centre de coût si tu le souhaite.
Par contre attention, si à la fin ce qui t’intéresse est de sortir un compte de résultat par centre de coût, le plus important est d’associer le centre de coût au produit (via écriture de journal ou lignes de facturation pour les prestations). Les comptes de banque sont des comptes de bilan, donc l’association avec un centre de coût servira uniquement dans le bilan.
Bon week-end!